موسسات معاف از ارزش افزوده

سلام و ادب موسسه ای که از ارزش افزوده معاف است، آیا ارزش افزوده های پرداختی بابت خرید کالا یا خدمات یا دارایی را بایستی به بهای تمام شده آنها لحاظ کند یا اینکه به عنوان پیش پرداخت ثبت نماید؟ سپاس از شما